Ακριβώς όπως το ακούτε, οι Πιγκουίνοι είναι στην πραγματικότητα κατάσκοποι που ενώνουν τις δυνάμεις τους με την μυστική ομάδα δράσης «Βόρειος Άνεμος» για να σταματήσουν τον μοχθηρό Δρ. Οκτάβιο Μυαλάτη πριν καταστρέψει τον κόσμο.
Ήταν θέμα χρόνου πριν αποκτήσουν οι πιγκουίνοι την δική τους ταινία, αφού μπορεί το λιοντάρι και η καμηλοπάρδαλη να προκαλούσαν το γέλιο στις ταινίες της Μαδαγασκάρης, αλλά οι κύριοι αυτοί έκλεβαν την παράσταση κάθε φορά που εμφανίζονταν στην οθόνη.
Όσο περίεργο κι αν ακούγεται, η ταινία είναι εμπνευσμένη από γνωστές κατασκοπικές ταινίες και κυρίως τον Τζέιμς Μποντ.
Στην Αμερική τις φωνές τους έχουν δανείσει ο Benedict Cumberbatch του Σέρλοκ και ο John Malkovic, ο οποίος δέχτηκε πολύ εύκολα να παίξει το κακό χταπόδι της ιστορίας.